校办公室是学校的行政综合管理、服务部门，主要职责是协助学校领导综合协调和处理学校行政和人事工作。
1、负责组织安排学校党政联席会议、校务工作会议、行政人员会议、全校教职工大会等重要会议，做好会议记录。
2、负责签报、送阅上级文件及外单位来文；组织草拟学校文件及其它文字材料；审核以学校名义发出的文稿；做好各类文件、通知、会议记录等传阅、整理、存档工作；严格保密制度。
3、认真做好来电、来信、函件（电子邮件）、来访的受理与接待工作，并做好记录；及时将有关事项向领导汇报，并协助做好落实和处理工作。
4、根据校领导意见，负责组织协调有关部门共同办理的综合性工作和全校性大型活动。
5、负责学校网站、微信公众号校长邮箱、电子屏幕等管理工作，做好学校的宣传报道相关工作。
6、协助校领导协调有关单位和部门，应急处理学校的重要突发性事件。负责协调安排中层以上干部行政值班工作。
7、负责全校教职员工的考勤、公示工作；办理教职工的请假和销假等相关工作；及时向大学人力资源部上报教职工月考勤信息。
8、负责学校印章的管理和使用，严格按照《科大附中公章管理和使用规定》使用印章；按要求和规定办理各种介绍信、证明和其他函件等。
9、协助校领导做好教职工人事管理、年终考核、有关奖项评审、专业技术职务（职称）评审聘用等相关工作的组织和安排。
10、负责教职工岗位津贴、有关津贴等审核、发放和调整相关工作。
11、智慧校园和学校信息化建设工作。
12、承办上级单位、学校部署、安排的有关工作，办理校领导交办的其他工作。
副主任：张栋宇 副主任：蒋克兢、李勇、徐晶晶
工作人员：赵子君、郑松文、韩巧珍、袁昊
电话、传真：63602213